По словам секретаря Епархии Германа Маршания в настоящее время Церковь и государство взаимодействуют в целях передачи под ее юрисдикцию храмов и их земель. Вопрос передачи Пицундского храма является первоочередным, поскольку это резиденция древнего абхазского епископата.
В связи с этим Церковь требует переноса органа, установленного здесь немецкими специалистами в советское время.
В настоящее время службы в храме не проходят, поскольку он функционирует как концертный зал.
Обсуждается вопрос строительства специального органного зала в Пицунде.
В Пицундском храме проходит ряд ежегодных популярных фестивалей классической музыки.